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Text File  |  1994-04-19  |  2.0 KB  |  41 lines
  1. Mapmaker II, Mapmaker QTL - Whitehead Institute
  2.  
  3. KEYWORDS: engineering, Biomedical Research and Lab Systems     , 617     
  4.  
  5. Software for Genetic Mapping
  6.  
  7. Mapmaker-II and Mapmaker/QTL are computer software packages for genetic mapping
  8. of simple genetic markers and genes controlling complex genetic traits
  9.  
  10. Mapmaker is an interactive computer package for constructing primary linkage
  11. maps of Mendelian genetic markers in both experimental and natural populations.
  12. It can be used to analyze the segregation of dominant, recessive, and
  13. co-dominant markers in either collected CEPH-type two and three generation
  14. nuclear family pedigrees, or in experimental intercrosses, backcrosses, and in
  15. nth generation recombinant inbred breeding programs. Mapmaker's unique
  16. linear-time algorithms allow multipoint linkage analyses not possible using
  17. other methods, and its user-friendly interface allows easy interactive
  18. exploration of one's data. Mapmaker is currently in use at over 100 sites
  19. around the globe, and has been used to produce linkage maps of over 40
  20. divergent species (from corn and rice to fungi and lizards), as well as in
  21. efforts to study over 20 human genetic diseases and to produce the first
  22. complete linkage map of the human genome
  23.  
  24. Mapmaker/QTL is a new program for mapping complex genetic traits in
  25. experimental crosses relative to established linkage maps. Mapmaker/QTL accepts
  26. genetic and trait data and can map putative quantitative trait loci (QTLs)
  27. contributing to particular phenotypes under models allowing polygenic
  28. inheritance and multilocus interactions, Mendelian allele interactions
  29. (additive, dominant, recessive, super-dominant, and others), non-genetic
  30. components, and normal quantitative variation. Mapmaker/QTL uses a
  31. user-friendly interface similar to Mapmaker's, and shares data files with
  32. Mapmaker for ease of use in research breeding programs. Mapmaker/QTL is also
  33. based on unique efficient algorithms which provide the first extensions of
  34. LOD-score based methods to quantitative genetic mapping.
  35.  
  36.  
  37.  
  38. Whitehead Institute
  39. Tel: (617) 258-5000
  40. Fax: (617) 258-5061
  41.